据《瞭望》新闻周刊第38期报道，大巴山国家级自然保护区是我国生物多样性保护17个关键地区之一，同时也是世界自然基金会确定的全球233个热点生态区之一。但这个生态地位重要、面积达11万多公顷、重庆市最大的自然保护区，有12个乡镇，3.3万多常住人口，其中贫困人口5000多人，村民多以传统种养殖业甚至采挖药材为生，对生态环境带来较大扰动。
　　类似这样的情况，在各级各类自然保护区中十分普遍：大量原住民在核心区缓冲区随意进出，生产生活和交通旅游等设施多，频繁的人类活动，使不少自然保护区出现普遍违法问题。
　　一项调查统计，重庆58个各类保护区常住人口约70万，其中核心区约有8万人，缓冲区18万多人，仅2个保护区无人居住。同时，一些自然保护区在设立前就有景区、企业等设施，导致诸多遗留问题难以解决。
　　几位受访基层干部表示，原住民干扰生态、已有的交通穿越和生产生活设施等造成自然保护区普遍违法，法不责众，基层想管又没法管。
　　据介绍，保护区设立程序不够细致，加上早期勘界技术落后，不少保护区将村镇、公路、基本农田、工矿企业等划入，带来一系列管理“后遗症”。还有受访者透露，有的自然保护区就是领导在地图上圈划出来的，还闹出“铅笔太粗，把隔壁区县甚至外省区域划进去了”的荒唐笑话。
　　受访专家及干部建议，应针对划定随意、管理粗放、法规滞后等问题，根据新形势，实事求是，促进自然保护区科学精细管理。